人気インターネットメディア「Tokyo Otaku Mode（TOM）」と観光庁が連携し、海外に向けて訪日プロモーションに取り組む。9月6日（金）、特設サイトもオープンした。
10月10日よりフジテレビ「ノイタミナ」ほかにて『サムライフラメンコ』の放送がスタートする。そのオープニングテーマに、ロックバンドSPYAIRのニューシングル「JUST ONE LIFE」を起用することになった。
アニメ『宇宙兄弟』は読売テレビ・日本テレビ系列にて夕方5時30分より絶賛放送中だ。10月からは新たに、3人組ロックバンドのtacicaがオープニングテーマを務めることになった。タイトルは「HALO」となっており、11月27日にはシングルがリリースされる。
レイ・ハリーハウゼンの特集上映が、この9月に実現する。映画監督の発掘、登竜門としても知られる映画祭PFF（ぴあフィルムフェスティバル）が、レイ・ハリーハウゼンの追悼特集を組む。
アメリカンコミックスと関連トイの専門店BLISTER comicsが、秋葉原に登場する。現在の日本橋浜町での営業を9月7日で終了、9月28日に秋葉原の新店舗をグランドオープンする。
松本零士の人気漫画を3Dアニメーションで映画化した『キャプテンハーロック』が9月7日（土）に公開を迎え、ボイスキャストの小栗旬に三浦春馬、荒牧伸志監督、そして松本先生が都内劇場で行われた舞台挨拶に登壇した。
9月7日、京都・みやこめっせ（京都市勧業館）にて京都国際マンガ・アニメフェア（京まふ）2013が開幕した。入場を待つ一般客の列が、会場を1周するなどで期待の高さを窺わせた。
『劇場版 魔法少女まどか☆マギカ ［新編］ 叛逆の物語』が、10月26日に全国公開となる。映画への関心がますます高まる中で、最新予告編が9月7日に公開された。場所は京都・みやこめっせである。
TSUTAYAオンライン・アニメストアの8月（8月1日～31日）の販売ランキングを、テレビ放映中の人気アニメ『Free!』が席巻した。月間ランキングの1位から3位まで独占した
アニメの映像・音楽ソフトを届けるTSUTAYAオンライン・アニメストアの8月（8月1日～31日）の販売ランキングがまとまった。映像ソフト1位となったのは、『ONE PIECE Log Collection “ROOKIES” 』である。
『劇場版「空の境界」未来福音』は9月28日にテアトル新宿ほか全国32館にてロードショーとなる。このたび、本作の来場者特典が決定した。原作者・奈須きのこさん書き下ろし小説「終末録音/the Garden of oblivion」を配布する。
映画「ホビット」シリーズの第2弾が、2014年2月28日に国内公開される。原題では『The Hobbit: The Desolation of Smaug』とされるタイトルは、邦題では『ホビット 竜に奪われた王国』とされた。
『PSYCHO-PASS サイコパス』が、新たな展開を迎える。9月7日、「PSYCHO-PASS サイコパス プロジェクト重大発表会」で、新たなテレビシリーズと劇場映画化が発表された。
THA BLUE HERBのメンバーO.N.Oさんが、別名義となるGramlineとして、英語で歌唱するボーカロイドソフト「初音ミク V3 ENGLISH」を使用したデモソング「New world by Gramline a.k.a O.N.O」を公開した。
9月6日、京都・みやこめっせにて「京都から世界へ！ マンガ・アニメがもたらす地域活性化」が開催された。KADOKAWAの経営者である井上伸一郎氏が登壇し、コンテンツと地域活性化について語った。
宮崎駿監督自身から、長編アニメ映画からの引退が発表された。そこで誰もが気になるのが、1986年の『天空の城ラピュタ』以来、監督の作品を製作し続けてきたスタジオジブリの行方だ。
9月6日14時より、京都・みやこめっせ（京都市勧業館）にてビジネスセミナー「『ONE PIECE』の海外ビジネスモデル」が開催された。東映アニメーションから取締役兼テレビ企画部長の清水慎治さんが登壇した。
日本のアニメ史に、大きな節目が訪れた。1980年代から今日まで、およそ30年にわたり日本のアニメーション史の中で大きな存在を持ってきたアニメーション監督、宮崎駿が長編映画の制作より引退する。
熊本県のご当地キャラクター“くまモン”が、また新たな分野に乗り出した。9月4日、くまモンが道案内するカーナビアプリ「マップルナビK」が発売になった。
2013年7月よりテレビ東京ほかにて『義風堂々!! 兼続と慶次』の放送がスタートした。9月5日にはスペシャルイベントが開催された。当日はキャスト陣より、直江兼続役の浪川大輔さんと前田慶次役の佐藤拓也さん、そしてスペシャルゲストとして原哲夫さんも姿を見せた。
『機動戦士ガンダム』とキヤノンのインクジェットプリンターPIXUSがコラボレーション企画「PIXUS×GUNDAM PROJECT」を立ち上げた。その第一弾として、3834枚のA4用紙を使った巨大コンテンツ「実物大シャア専用ザクグラフィック」が制作された。
『サイボーグ009』のアメコミ版『サイボーグ009 USAエディション』が7月19日にリリースされた。本作はアメコミにイメージソングを付けるという世界初のプロモーションを行った。9月6日にはそのミュージックビデオの配信がスタートした。
「月刊ヤングマガジン」(講談社)にて連載中の『COPPELION(コッペリオン)』のアニメ化が、制作発表から3年の時を経て再始動した。このたび、その放送情報が発表となった。AT-Xで10月2日21時、BS11では10月4日23時30分より放送がスタートする。
