他のコンテストにない吉祥寺アニメーション映画祭の特色のひとつが、吉祥寺にゆかりのアニメやマンガの制作スタジオなどからの各賞である。こちらはSTUDIO4゜C賞に黒木智輝さんの『CYCLOID』、コアミックス賞に荻野夏生さんの『Rat in a Book』、スタジオディーン賞に平川侑樹さんの『Candle night』、三鷹の森ジブリ美術館賞に馬場美紀さんの『ネジとねこ』、ガイナックス賞に今林由佳さんの『みゃくみゃく-Drops of Life-』となった。 ガイナックス賞は今回から新たに加わった。審査員のアサオヨシノリさんは、ガイナックスの3DCG部門として設立された吉祥寺トロンの代表を務めている。このほどアニメが放送された『ステラ女学院高等科C3部』の企画者でもある。